Üniversite-özel sektör işbirliğinin artırılması amacıyla yola çıkılan protokol, taraflar olan URAK ve Boğaziçi Üniversitesi'nin imzasıyla Temmuz 2009 tarihi itibariyle yürürlüğe girmiştir. Üniversitenin bilimsel çalışmalarına destek verecek ortak projeler üretmek ve sanayi işbirliklerin başlatmak, eğitim ve seminler düzenlemek, öğrencilere staj imkanı sağlamak vb. faaliyetlerin hayata geçirilmesi amacıyla imzalanan protokol kapsamında ilk eğitim Ağustos ayında KOSGEB uzamanlarına verilmiştir.